A mais antiga ocupação humana identificada até à data no Lagar Velho ocorreu há 29.000 anos, quando um grupo de caçadores-recolectores aproveitou uma reentrância existente na parede de fundo do abrigo para enterrar uma criança que pereceu no decurso do seu quinto ano de vida. Este evento ocorreu durante uma ocupação temporária do sítio, relacionada com atividades domésticas, como sugerem os vestígios que têm vindo a ser escavados poucos metros a poente do espaço sepulcral. Nos milénios seguintes, o local continua a ser visitado por outras gerações do Paleolítico Superior, pelo menos até há 24.000 anos. Infelizmente, a história do sítio foi truncada pelas garras de uma retroescavadora que, no entanto, trouxe à luz do dia um dos achados mais importantes e emblemáticos da Pré-história europeia.