O Vale do Lapedo, onde se localiza o Abrigo do Lagar Velho, lembra uma cicatriz bem profunda desenhada na paisagem. De paredes verticais, onde se abrem inúmeros abrigos aproveitados ao longo dos tempos por humanos e animais, este vale preserva ainda hoje muita da sua autenticidade ecológica. Espécies vegetais autóctones, especialmente de ambiente ripícola, ainda se podem observar nas suas margens.
O sítio encontra-se no troço final do vale, numa plataforma alongada virada a norte, para a ribeira da Caranguejeira, sob o maior abrigo descoberto até à data no Vale do Lapedo.